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服務


Ablink提供多種高通量突變引物的設計和合成服務。


1. NNK簡并引物

NNK簡并密碼子包含了32種密碼子組合,覆蓋了所有20種氨基酸殘基,是構建文庫常用的簡并密碼子。

EXAMPLE:

5GGCCCTAACGGATAACCG(NNK)6GCCAATTCATGCACCTTACG3

N=A/C/G/T, K =G/T


2. IUBcode簡并引物

通過混合2-4種堿基,核苷代碼由單一的A、T、C、G拓展到R、Y、......N等11種混合核苷代碼(IUB code,詳見下表)??蛻羰褂肐UB code構建不同的密碼子組合,可以在突變位點形成固定氨基酸的組合。


EXAMPLE:

5GTCTATTATTGTAGCCGCTGGGGA(DVK)5GCTATGGACTACTGGGGTCAAG3

D =A/G/T, V=A/C/G, K =G/T. DVK簡并密碼子包含了18種密碼子組合,覆蓋12種氨基酸殘基(Ala,Arg,Asn,Asp,Cys,Gly,Glu,Lys,Ser,Thr,Trp,和Tyr)。


3. Trimer簡并引物

使用單一核苷(monomer)合成的簡并引物,在突變位點會不可避免的產生冗余突變和終止密碼子。將三個核苷按固定順序連接起來所形成的三聯核苷(Trimer Phosphoramidites)可以對應單一的氨基酸。以Trimer混合物作為元件設計的簡并引物,能夠保證突變位點的氨基酸按照設計的比例構成,滿足特定位點的氨基酸多樣性和偏好性。


EXAMPLE:

5GCAACTTATTACTGTCAGCAA(X)3-7CYGWTCACGTTCGGACAGGG3

X Trimers=Y(25%)/S (20%)/G(20%)/A(10%)/F(5%)/W(5%)/H(5%)/P(5%)/V(5%)


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